İnanılmaz Örümcek Adam, lisede zor bir dönem geçiren Peter Parker'ın hikayesini anlatıyor. Anne ve babası tarafından terk edilen Peter, dayısı ve yengesi tarafından büyütülmektedir. Bir gün babasına ait bir evrak çantası bulan Peter, ailesinin kayboluşunu araştırmaya başlar. Bu araştırma süreci onu Oscorp'a ve babasının eski ortağı olan Dr. Curt Connor'un laboratuvarına götürür. Burada Peter, özel güçlerini keşfeder ve Örümcek-Adam olmaya karar verir. Aynı zamanda, Gwen Stacy ile olan aşkı ve bağlılığıyla da mücadele etmek zorunda kalır. Ancak, Connor'un ikinci kişiliği olan tehlikeli bir yaratığa karşı savaşmak zorunda kalır. Peter, kahraman olmak için çıktığı bu yolculukta hayatını tamamen değiştirecek bir karar verir. Örümcek Adam olarak, sırlarını çözmeye ve insanlığı korumaya çalışırken, kendi kimliğini de bulmaya çalışır.