Teenage Mutant Ninja Turtles, radyasyona maruz kalan dört minik kaplumbağanın insan boyutlarına dönüşmesi ve bir fare tarafından dövüş sanatlarında eğitilmeleri ile başlayan hikayeyi anlatıyor. Kaplumbağalar, suçla savaşmaya yönlendirilen Splinter efendi tarafından Michelangelo, Raphael, Leonardo ve Donatello isimlerini alır. Bir televizyoncu olan April, ninja kaplumbağaların varlığını keşfeder ve onlarla güven kazanarak kötü savaş beyi Shredder'ın planlarını engellemeye kararlı bir şekilde birlikte çalışır. Bu heyecan dolu macera, dostluğun, mücadelenin ve birlikte çalışmanın önemini vurgulayan eğlenceli bir aksiyon filmidir.