Fox Klanının başkanı Rikka Isurugi (Chihiro Yamamoto), Shogunate'ye karşı bir isyan planladığından şüphelenilen gizemli bir tarikat olan "Beyaz Lotus"u araştırıyor. Görevi sırasında Shogun tarafından gönderilen bir Fuma Ninjası olan Okyo (Kanon Miyahara) ile karşılaşır. Zorlu bir ortak düşmanla karşı karşıya kaldıklarında yolları birleşiyor: Tokugawa ailesine karşı derin bir intikam besleyen Hattori Hanzo'nun (Kane Kosugi) liderliğindeki Iga Ninja klanı. Fox Clan, Fuma Ninja ve Iga Ninja arasında üçlü bir çatışma başlamak üzere.