Mononoke the Movie: The Phantom in the Rain, Edo dönemi Japonya'sında geçen bir hikayeyi konu ediyor. Film, Edo hareminin odalarında geçen entrikaları, rekabeti ve intikamı konu alıyor. Hikaye, iki yeni gelen karakterin siyasi entrikaları gün yüzüne çıkarmasıyla başlıyor. İlaç satıcısı olan baş karakterimiz, bu entrikalara karşı mücadele verirken, bir intikamcı ruhun varlığını keşfeder. Bu ruh, sadece gezici ilaç satıcısının yenilebileceğini düşünmektedir ve onunla yüzleşmek zorunda kalacaktır. Film, gizemli bir atmosferi ve etkileyici bir hikayeyi izleyiciye sunarak, Japon kültürüne ve tarihine de dokunuyor.