Me, Natalie, çirkin görünüşlü bir genç kızın hikayesini anlatıyor. Natalie, annesinin güzellikle büyüyeceğine dair sözlerine rağmen kendini çirkin hisseder. Eksantrik bir ev sahibinden dairesini kiralayan Natalie, üstsüz dip kulübünde çalışmaya başlar. Bir sanatçı olan David ile tanışır ve bir ilişki yaşar. Ancak daha sonra David'in evli olduğunu öğrenir. Natalie'nin hayatındaki bu dönemde kendi kimliğini bulma ve kabul etme süreci anlatılıyor. Filmde sıra dışı karakterler, ilişkiler ve toplumdaki kabul görme arayışı işleniyor. Me, Natalie, çirkinlik algısı ve yaşamın zorlukları üzerine düşündüren, dokunaklı bir hikaye sunuyor.