İlişki Doktoru filmi, evliliklerin zorluklarını ve ilişkilerin nasıl gelişebileceğini anlatan duygusal bir hikayeyi konu alıyor. Önder ve Aylin'in 9 yıllık bir evlilikleri vardır ancak sorunlarla dolu bir ilişki yaşamaktadırlar. Önder'in neşeli ve sorumsuz tavırları, Aylin'in ise onu aile sorumluluklarını almamakla suçlaması ilişkilerini zorlaştırmaktadır. Aylin, evdeki ekonomik sıkıntılardan ve Önder'in tutarsız davranışlarından rahatsızdır ve ayrılık kararı alır. Bu noktada Özgür, Önder'i destekleyerek onun ilişki uzmanı kimliğini kullanarak televizyon programlarına çıkmasını sağlar. Bu durum, Önder'in kaderini değiştirir ve artık tanınan bir isim haline gelir. Film, ilişkilerin karmaşıklığını ve insanların değişebileceğini, aynı zamanda umutsuz durumlardan dahi çıkış yollarının bulunabileceğini seyirciye aktarıyor.