1792 İspanya... Katolik Kilisesi'nin en güçlü olduğu dönem... Goya (Stellan Skarsgrad), ülkenin en tanınmış ressamıdır. Goya'nın genç ve güzel esin perisi Ines'in (Natalie Portman) Engizisyon Mahkemesi'nin arkasındaki güçlü bir rahip tarafından, toplumsal değerlere ters davranış ile suçlanması büyük bir skandal yaratır. Güzel model Ines haksız yere Engizisyon mahkemesi tarafından mahkum edilip eziyet görünce, Goya'nın daha önceki arkadaşı rahip Lorenzo (Javier Bardem) ile olan arkadaşlığı sınanır. Goya, Lorenzo'ya Ines'in hayatının bağışlanması için yalvarır. Lakin Lorenzo gücün peşindedir ve Engizisyon'un arkasındaki asıl güçlerin başıdır. Ines hapse atılır, eziyet görür ve ölümle baş başa bırakılır.