Boîte noire, genç ve yetenekli bir kara kutu analisti olan Matthieu'nun hikayesini anlatıyor. Bir uçak kazasının ardındaki gerçeği ortaya çıkarmakla görevlendirilen Matthieu, kazanın nedenini çözmek için elinden geleni yapar. Ancak, yetkililer tarafından dava kapatılmaya çalışıldığında bile, Matthieu'nun içinde bir sorun olduğunu hissettiği kanıtlar vardır. Kara kutunun kayıtlarını tekrar dinlerken, bazı rahatsız edici ayrıntıları fark eder. Acaba bant değiştirilmiş mi? Matthieu, patronunun emirlerine karşı gelerek kendi benzersiz soruşturmasına başlar. Boîte noire, gerilim dolu bir hikayeyle birlikte, gerçeği ortaya çıkarmak için verilen mücadeleyi aktarıyor.